Občasno se voda v akvariju začne motiti. Razlogov, zakaj se tak postopek zgodi, je veliko. Lahko je povezan tako z življenjem rib kot s kakovostjo hrane ter z različnimi predmeti v akvariju, vključno s filtrom. Motnje vode v akvariju samo po sebi ni nevarno, kljub temu pa je treba ugotoviti in odpraviti vzroke tega pojava.
V večini primerov je vzrok motne vode množično razmnoževanje bakterij. Če je vaš akvarij nov, vam ni treba skrbeti - to je povsem normalno in bo sčasoma minilo. Če je vaš akvarij že dolgo "dozorel", potem obvezno presadite ribe v drugo posodo in zamenjajte vodo. Včasih se voda začne motiti zaradi nepravilne uporabe kemikalij. Zato še enkrat natančno preberite navodila, da najdete svojo napako, nato pa ribe prestavite v drug akvarij, saj obstaja nevarnost zastrupitve. Voda lahko postane tudi motna zaradi hrane, ki takoj začne razpadati v vodi - še preden se absorbira riba. Sem spadajo na primer sveže meso ali nepravilno odmrznjena hrana. V tem primeru spremenite prehrano prebivalcev akvarija z uporabo visokokakovostne hrane. Včasih voda začne barvati v drugačne, povsem neznačilne tone. V večini primerov je to posledica barve okraskov v akvariju. Na primer, šota ali les obarva vodo rjavo, rožnati gramoz pa ji daje rdečkast odtenek. V večini primerov ta pojav ni nevaren za ribe. Da se znebite nenavadnih odtenkov, vodo preprosto obdelajte s tabletami aktivnega oglja, saj so odlični absorbenti. Voda lahko postane motna zaradi dvigovanja snovi, ki so se nabrale v substratu akvarija. Sprostitev takšne snovi lahko nastane kot posledica dejavnosti rib ali osebe same. Ne skrbite zaradi tega - mulo mora sistem za filtriranje odstraniti. Če se voda začne zamegljevati, preverite filter - morda je pokvarjen ali ne deluje dovolj intenzivno. Precej pogosto so mrtve ribe vzrok za onesnaženje vode. V velikem akvariju je precej težko videti majhne mrtve ribe, ki tonejo na dno. Zato poskusite čim pogosteje preverjati akvarij in njegove hišne ljubljenčke. Če najdete mrtve ribe, jih takoj ulovite iz vode, saj se začnejo zelo hitro razgrajevati.